Completamento tettoia in legno su muratura...

Assolutamente sì... esistono dei sigillanti acrilici nati proprio allo scopo
hanno un modulo elastico relativamente basso (cioè sono abbastanza elastici) in modo da seguire i movimenti di assestamento, vibrazioni, dilatazioni termiche e allo stesso tempo sigillano all'aria, polvere, rumore
non sono adatti per contatto continuativo con acqua per cui se temi che possa esserci questa eventualità nel punto in cui intendi sigillare ti consiglio in alternativa un silicone neutro (a base alcolica)... ad esempio fischer ne ha uno per lattoneria/edilizia o uno per serramenti che si presta altrettanto bene allo scopo
perché aderiscono efficacemente sia alla muratura sia al legno

questi sigillanti (siliconi o acrilici) sono venduti in cartuccia per pistola "silicone" e si mettono in opera creando dei cordoni di sigillatura aventi lati di adesione non inferiore ai 6mm;
ricordo anche la classica regola di dimensionare il giunto in modo che la profondità dello stesso sia sempre la metà della larghezza (in questo modo il sigillante può reticolare per bene e funzionare propriamente come una "molla")