Problemi con appalto !

Ciao,
stiamo ristrutturando un casale di nostra proprietà ed abbiamo stipulato un contratto d'appalto "chiavi in mano". Al contratto è allegato il progetto ed un capitolato dove sono, in maniera non puntuale , elencati il tipo di sanitari, infissi, pavimenti ecc. Per quanto riguarda i pavimenti abbiamo scelto del cotto fatto a mano semilevigato .... e qui il primo problema: l'appaltatore si rifiuta di fare il trattamento del cotto (imprescindibile per quel tipo di pavimento) perché sostiene che non è menzionato come voce nel capitolato (che ripeto non preciso alla virgola) e che quindi dobbiamo pagarlo noi (l'appalto è chiavi in mano). Inoltre sempre nel capitolato non è menzionato il battiscopa ... e quindi vuole farci pagare anche quello (che poi non è altro che una striscia di colore diverso sull'intonaco). Siamo esasperati, questi non sono che gli ultimi di una serie di problemi, problemini e problemoni. Che fare ? paghiamo noi, ci facciamo fare fattura e poi scalo dal saldo finale ? Grazie