Iva agevolata prima casa - 33131

Salve,
ho acquistato una casa "sulla carta" direttamente dalla ditta costruttrice.
La casa è in via di ultimazione e si è arrivati al momento dei pagamenti.
Ho richiesto al costruttore di eseguire delle modifiche all'appartamento per un totale di circa 5000? oltre il costo della casa pattuito.
Al momento dei conti l'impresario mi ha calcolato l'IVA sulle modifiche con l'aliquota del 20% anziché con il 4% previsto per la prima casa: è corretto? non dovrebbe essere calcolata anche per queste modifiche l'IVA al 4%?
Alle mie rimostranze il costruttore si è giustificato dicendo che secondo il suo commercialista in questo caso l'agevolazione al 4% non è dovuta perché trattasi di lavori extra e che se vorrò farmi applicare l'Iva al 4 dovrò presentargli una liberatoria dove dichiaro di essere a conoscenza del fatto che mi spetta l'Iva agevolata al 4% e che mi faccio carico della responsabilità laddove così non fosse. E' corretto?
Quali sono le conseguenze a cui potrei andare incontro nel caso in cui mi facessi carico delle responsabilità così come richiestomi?

Grazie.