Siliconare il battiscopa di legno

Ho ristrutturato un edificio rurale nel centro storico di un borgo della Sabina.
Pavimento in rovere di Slavonia e battiscopa di legno massello, dipinto di bianco per confondersi con l'intonaco dei muri, lungo tutti i perimetri.
Mi è stato raccomandato di siliconare tra il battiscopa ed il parquet e tra il battiscopa ed il muro.
Io e l'impresa che me lo ha posato siamo contrari in quanto si impedisce ai muri di "respirare".
Preciso che si tratta di una costruzione in pietra e che la ristrutturazione è stata eseguita secondo criteri di massima sicurezza (antisismica) e salubrità (contro l'umidità).
Gradito un autorevole parere del Forum...