Negozio composto da due unità catastalmente separate

Carissimi,
sono il conduttore di un negozio formato da due unità immobiliari adiacenti, catastalmente separati, ciascuno dotato di un proprio ingresso dalla strada.
Negli anni 60' venne eliminato, con il comune accordo dei due proprietari, il muro di separazione tra i due locali ma tale modifica non è stata mai comunicata ufficialmente; di fatto è come se esistesse ancora il muro.
Nel corso degli anni il negozio è stato locato utilizzando sempre due contratti di locazione, afferenti a ciascun proprietario, ed anche io ho tuttora in corso due contratti di locazione.
Adesso vorrei effettuare dei lavori di ristrutturazione ma vorrei capire come devo affrontare la richiesta dei permessi senza alterare la diversa proprietà dei due locali.
Grazie