Fattura 55% pagata in acconto e saldo

Salve a tutti, stiamo ristrutturando la casa usufruendo delle agevolazioni del 36% e del 55%.
Per quanto riguarda l'isolamento del tetto, è stata emessa una fattura che ho pagato prima in acconto e successivamente in saldo, visto che l'importo era elevato.
Avevo chiesto delucidazioni al mio Caaf di fiducia e mi era stato detto che si poteva fare.
Ora però più di una persona mi ha detto che per ogni fattura si deve fare un solo bonifico, mentre il Caaf continua a dirmi che potevo fare come ho fatto.
Così spippolando in internet ho trovato questo bel sito, mi sono subito registrato e pongo il quesito a voi, scusandomi in anticipo se questa domanda è già stata fatta in precedenza.
Grazie mille