Come fatturare e come pagare?

Salve, ho un immobile in corso di ristrutturazione radicale. Vista la cifra importante che sto spendendo ho deciso di chiedere per una parte (fino a 48.000 euro) le agevolazioni del 36% e per quello che riguarda gli isolamenti gli infissi e gli impianti la detrazione del 55%.
I lavori sono in corso e finiranno tra qualche mese.
Fino ad ora per l'impresa mi ha fatto fatture a stato avanzamento lavori, sono di acconto, deve essere specificata la parola ACCONTO? sono fatture cumulative generiche, non specificando nè materiali ne manodopera so che essendo acconti non è necessario giusto?

Per i costi relativi al miglioramento energetico so che le fatture devono essere separate, quale causale va scritta nel bonifico? Visto che per il risparmio energetico ne arriveranno altre di fatture prima della fine dei lavori, devo ogni volta far specificare tutto? o come per il 36% è importante che sia specifica solo l'ultima? Devo specificare ACCONTO?

Anche gli operatori dell'Agenzia delle entrate fanno una gran confusione in merito, io devo pagare e non vorrei trovarmi nella situazione di perdere importanti benefici.
Grazie come al solito.
Pamela