Iva, detrazioni....

Sto ristrutturando un appartamento e ho una gran confusione. I costi dei lavori supereranno i 48000 euro, ma mi chiedo: alcune cose che pago con il 10% di IVA (es pavimenti in legno), devo pagare comunque con bonifico e poi presentare il documento con il 730? Cioè, non capisco se posso avere l'IVA al 10%, pagare con bonifico e poi non presentare la fattura per la detrazione al 36%, perché preferisco presentare alla detrazione i lavori più costosi (idraulico, eletricista, operare di muratura...)
E per le finestre, come posso fare per avere la detrazione al 55%? Ho inviato a dicembre 2006 la comunicazione a Pescara
Grazie a chi riesce ad aiutarmi!!