Pagamento IMU 2014

Ho acquistato la mia prima casa ed unico immobile in possesso in data 3 luglio 2014.
Lavoravo e lavoro già da prima dell'acquisto della casa nello stesso Comune ma abitavo in affitto.
Nella nuova mia abitazione acquistata non sono potuto andare ad abitare fino a questo fine del mese di settembre a causa di lavori di ristrutturazione eseguiti e regolarmente denunciati al Comune che ha rilasciato regolare permesso.
Per questo motivo la domanda d residenza e domicilio nella nuova abitazione l'ho prodotta il 20 del mese di settembre.
Ora il Comune pretende di farmi pagare l'IMU per 3 mesi (Luglio-Agosto e Settembre) considerandola seconda abitazione.
Ma se io sono proprietario dell'unica abitazione appena acquistata, e solo per motivi di forza maggiore (lavori in corso) non ho potuto andare ad abitarci subito, che colpa ne ho, e se oltretutto, al momento dell'atto notarile di acquisto mi è stato riferito che avevo 12 mesi di tempo per trasferire la nuova residenza senza perdere la definizione di prima ed unica abitazione principale:
Mi sapete dire se devo o no pagare l'IMU come dice il Comune per i primi 3 mesi dall'acquisto e poi esserne esente?
Attendo un Vostro parere e con l'occasione ringrazio anticipatamente.
Flavio Ottorino Mario