Chi paga? - 21791

Sto ristrutturando una casa e dopo aver rifatto completamente il tetto il comune mi ha bloccato i lavori perché il cordolo su cui poggiano le travi risulta 40/50 cm più alto di quanto previsto in progetto. Secondo me L' errore è stato chiaramente della ditta che sta eseguendo i lavori e dell' architetto preposto al controllo (anche perché io non ci guadagno niente con quei cm in più ). Eventualmente non si riuscisse a far passare una "variante al progetto" chi paga per la demolizione e ricostruzione del tetto? E chi paga per eventuali multe derivanti dalla denuncia del comune?
Il proprietario (mio padre) che rischi corre?