Come funziona il rimborso per le villette (seconda casa) indipendenti?

Salve a tutti,
ho questo quesito da proporre e mi servirebbe per favore un aiuto.
Nel 2016 ho fatto vari lavori di manutenzione ordinaria nella mia casa al mare (definita al catasto villetta) per problemi gravi di infiltrazione.
Il geometra ha provveduto a fare le analisi in loco e a produrre la perizia e il comune era stato informato degli inizi lavori e società competente.
Fatture e bonifici fatti come sempre in modo corretto per avere i rimborsi fiscali ora la mia commercialista che tra l'altro mi ha contattato alla fine della consegna del 730 quando aveva i documenti a disposizione da un sacco di tempo mi dice che potrebbero esserci dei problemi.
Sulle pavimentazioni esterne che ho dovuto rifare per i problemi di infiltrazione la agenzia delle entrate non avvalora questo tipo di lavori sul discorso che la mia abitazione (ricordo a catasto segnata come villetta) non e a schiera, ma indipendente.
Volevo capire come procedere perché non ci sto a perdere tutto quel rimborso fiscale.
Grazie
Arnaldo