Dia x ampliamento e ristrutturazione

Salve il mio tecnico ha aperto una DIA per ampliamento, ma nello stesso tempo il mio villino viene totalmente stravolto nelle aperture finestre, dislocazione locali, rifatti tutti gli impianti, il Vespaio etc. Praticamente restano solo le pareti perimetrali in piedi. Ho intenzione per l'ampliamento di richidere solo l'iva al 4 % alla ditta, e poi di usufruire con fatture separate pagate con i relativi bonifici, del relativo Bonus fiscale del 50 %.
LA mia domanda è:
Ci sono problemi per il fatto che nella DIA ci sia scritto solo ampliamento Villa unifamiliare ?? In allegato ci sono i progetti da dove si evince che tutto cambia.
Seconda domanda, trattandosi di una radicale ristrutturazione, i beni finiti li pago tutti al 10 % di iva o si deve fare il conteggio dato dalla differenza fra manodopera e beni ??
Terza domanda, interviene solo una ditta, non dovrei fare comunicazione all' ASl, anche se poi il certificato finale per avere a norma gli impianti lo rilascia un altra ditta ??

Grazie mille per le info